El Consejo Intergubernamental es la máxima autoridad del Programa, correspondiéndole la definición de sus objetivos, resultados y actividades, así como decidir el funcionamiento y la organización del mismo.
Conforman el Consejo Intergubernamental del Programa los máximos responsables a nivel nacional en materia de seguridad vial de los países adheridos al mismo
Funciones del Consejo Intergubernamental:
- Aprobar el Plan Estratégico que regirá la vida del Programa.
- Elaborar y aprobar el Reglamento de funcionamiento del Programa.
- Aprobar el Plan Operativo Anual (POA) y su correspondiente presupuesto.
- Dar seguimiento a las actividades y verificar su ejecución y gasto.
- Aprobar las acciones y proyectos que surjan producto de sus deliberaciones.
- Elegir al Presidente/a del Consejo Intergubernamental y a los miembros del Comité Ejecutivo.
- Elegir al Secretario/a Técnico del Programa, así como la ubicación y estructura de la Unidad Técnica